Paquet : r-bioc-deseq (1.39.0-10)

[ Paquet source : r-bioc-deseq  ]

analyse d’expression différentielle de gène avec GNU R

Il s’agit d’un paquet de BioConductor pour estimer la dépendance à la moyenne de variance dans des données de comptage issues d’analyses de séquençage à haut débit et pour tester l’expression différentielle basée sur un modèle utilisant une distribution binomiale négative.

Autres paquets associés à r-bioc-deseq

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.4) [non arm64, ppc64el]

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.21.7)

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.7.5)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genefilter

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• dep: r-bioc-geneplotter

  paquet de R de fonctions de tracé de données génomiques

• dep: r-cran-lattice

  paquet GNU R pour les graphes « Trellis »

• dep: r-cran-locfit

  GNU R local regression, likelihood and density estimation

• dep: r-cran-mass

  paquet GNU R pour MASS de Venables et Ripley

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-cran-gplots

  paquet de GNU R d’outils de tracé de données de Greg Warnes et autres

Télécharger r-bioc-deseq

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	1 928,1 ko	2 635,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1 927,9 ko	2 686,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1 929,3 ko	2 685,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1 927,8 ko	2 685,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1 928,0 ko	2 634,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1 927,7 ko	2 686,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	1 927,7 ko	2 685,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1 928,3 ko	2 685,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1 927,4 ko	2 629,0 ko	[liste des fichiers]