Paquet : vsearch-examples (2.22.1-1)

[ Paquet source : vsearch  ]

données de test pour l’outil vsearch de traitement de séquences métagénomiques

Il s’agit d’un outil polyvalent 64 bits multiprocessus pour le traitement de séquences métagénomiques, incluant la recherche, la mise en grappe, la détection de chimère, la déréplication, le tri, le masquage et le brassage.

Le but de ce projet est de créer une alternative à l’outil USEARCH développé par Robert C. Edgar (2010). Ce nouvel outil devrait :

 – avoir une conception 64 bits prenant en charge de très grandes bases de
   données et bien plus que 4 Go de mémoire ;
 – être aussi précis, sinon plus que usearch ;
 – être aussi rapide, sinon plus que usearch.

Ce paquet fournit un jeu de données de test ainsi que des scripts d’exemple exécutant quelques tests fournis par Debian en tant qu’autopkgtest.

Autres paquets associés à vsearch-examples

• enh: vsearch

  outil pour le traitement de séquences métagénomiques

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	3 398,5 ko	3 404,0 ko	[liste des fichiers]