Paquet : r-bioc-oligo (1.62.2+ds-1)

[ Paquet source : r-bioc-oligo  ]

Preprocessing tools for oligonucleotide arrays

A package to analyze oligonucleotide arrays (expression/SNP/tiling/exon) at probe-level. It currently supports Affymetrix (CEL files) and NimbleGen arrays (XYS files).

Autres paquets associés à r-bioc-oligo

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-affxparser (>= 1.39.4)

  kit de développement logiciel d'analyse de fichiers Affymetrix

• dep: r-bioc-affyio (>= 1.35.0)

  outils BioConductor pour l'analyse de fichiers de données d'Affymetrix

• dep: r-bioc-biobase (>= 2.27.3)

  fonctions de base pour Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.11)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.35.12)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-oligoclasses (>= 1.29.6)

  classes pour des tableaux de grande capacité gérés par oligo et crlmm

• dep: r-bioc-preprocesscore (>= 1.29.0)

  collection de fonctions de prétraitement de BioConductor

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi (>= 0.3.1)

  paquet de GNU R fournissant une interface généraliste de base de données

• dep: r-cran-ff

  Memory-Efficient Fast-Access Storage of Large Data

• dep: r-cran-rsqlite (>= 1.0.0)

  Database Interface R driver for SQLite

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

• sug: r-bioc-annotationdbi

  GNU R Annotation Database Interface pour BioConductor

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-biomart

  interface de GNU R aux bases de données BioMart (Ensembl, COSMIC, Wormbase et Gramene)

• sug: r-bioc-genefilter

  méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce

• sug: r-bioc-limma

  modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rcolorbrewer

  paquet de GNU R fournissant des palettes de couleurs adaptées

• sug: r-cran-rcurl

  GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface

• sug: r-cran-runit

  paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-oligo

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	900,7 ko	1 355,0 ko	[liste des fichiers]