Paquet : r-bioc-metapod (1.6.0+dfsg-2)

[ Paquet source : r-bioc-metapod  ]

méta-analyse avec GNU R de valeurs-p d’analyses différentielles

Ce paquet met en œuvre diverses méthodes pour combiner les valeurs-p dans des analyses différentielles d’ensembles de données à l’échelle du génome. Les fonctions peuvent combiner des valeurs-p à travers différents tests dans la même analyse (par exemple, des fenêtres génomiques dans des ChIP-seq, des exons dans le séquençage de l’ARN) ou pour des correspondances de tests à travers des analyses différentes (par exemple, des comparaisons répétées, des effets de conditions de traitement différentes). Une prise en charge est fournie pour la gestion de valeurs-p d’entrée transformées en log, les valeurs manquantes et la pondération lorsque c’est approprié.

Autres paquets associés à r-bioc-metapod

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-cran-rcpp (>= 1.0.7)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	193,1 ko	489,0 ko	[liste des fichiers]