Paquet : r-bioc-bsgenome (1.66.3-1)

Liens pour r-bioc-bsgenome

Ce module de BioConductor fournit quelques infrastructures basiques pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings.

dep: r-api-4.0

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-2)

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

GNU R string objects representing biological sequences
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.25.6)

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.10)

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.16)

conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers
dep: r-bioc-rsamtools

importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R
dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.28)

BioConductor S4 implementation of vectors and lists
dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.3)

BioConductor representation and manpulation of external sequences
dep: r-cran-matrixstats

GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

rec: r-bioc-biovizbase (>= 1.14.0)

GNU R basic graphic utilities for visualization of genomic data

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	6 832,9 ko	8 079,0 ko	[liste des fichiers]