Paquet : libhts3 (1.16+ds-3)

[ Paquet source : htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libhts3

• dep: libbz2-1.0

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  compression et décompression de tampon complet rapide basée sur DEFLATE

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  librairie de compression au format XZ

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libhts3

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
ppc64el	453,9 ko	1 511,0 ko	[liste des fichiers]