Paquet : changeo (1.3.0-1)
Liens pour changeo
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source changeo :
- [changeo_1.3.0-1.dsc]
- [changeo_1.3.0.orig-debian-tests-data.tar.gz]
- [changeo_1.3.0.orig.tar.gz]
- [changeo_1.3.0-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [changeo.readthedocs.io]
Paquets similaires :
boîte à outils d’affectation clonale de répertoire – Python 3
Change-O est un ensemble d’outils pour traiter la sortie d’outils d’alignement V(D)J, affecter des groupes clonaux à des séquences d’immunoglobuline (Ig) et reconstruire des séquences de lignées germinales.
D’importantes améliorations dans les technologies de séquençage à haut débit permettent maintenant de caractériser à grande échelle des répertoires Ig, définis comme l’ensemble de protéines réceptrices d’antigènes transmembranaires situées à la surface des cellules B et des cellules T. Change-O est une suite d’outils permettant de faciliter l’analyse avancée de séquences Ig et TCR suivant l’affectation de segments de lignées germinales. Change-O gère la sortie de IMGT/HighV-QUEST et d’IgBLAST et fournit une grande variété de méthodes de regroupement (clustering) pour affecter des groupes clonaux à des séquences Ig. Le tri d’enregistrements, le groupement et diverses opérations de manipulations de bases de données sont également inclus.
Ce paquet installe la bibliothèque pour Python 3.
Autres paquets associés à changeo
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- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
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- dep: python3-airr
- Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences
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- dep: python3-biopython
- bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique
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- dep: python3-numpy
- gestion rapide des tableaux avec le langage Python 3
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- dep: python3-pandas
- structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »
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- dep: python3-pkg-resources
- découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources
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- dep: python3-presto
- toolkit for processing B and T cell sequences (Python3 module)
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- dep: python3-scipy
- outils scientifiques pour Python 3
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- dep: python3-yaml
- analyseur et générateur de code YAML pour Python3
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- rec: python3-presto (>= 0.6.2)
- toolkit for processing B and T cell sequences (Python3 module)
Télécharger changeo
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 105,4 ko | 701,0 ko | [liste des fichiers] |