Paquet : libvcflib1 (1.0.3+dfsg-2)

[ Paquet source : libvcflib  ]

C++ library for parsing and manipulating VCF files

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

Étiquettes: Rôle: Bibliothèque partagée

Autres paquets associés à libvcflib1

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

  library for entropy measurement of byte streams

• dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [non amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

  determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

Télécharger libvcflib1

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	149,0 ko	413,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	129,2 ko	405,0 ko	[liste des fichiers]
armel	132,2 ko	405,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	125,3 ko	277,0 ko	[liste des fichiers]
i386	153,2 ko	417,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	134,5 ko	487,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	138,1 ko	483,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	153,0 ko	533,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	133,0 ko	417,0 ko	[liste des fichiers]