Paquet : samblaster (0.1.26-4)
Liens pour samblaster
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source samblaster :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
marks duplicates, extracts discordant/split reads
Current "next-generation" sequencing technologies cannot tell what exact sequence they will be reading. They take what is available. And if some sequences are read very often, then this needs some extra biomedical thinking. The genome could for instance be duplicated.
samblaster is a fast and flexible program for marking duplicates in read-id grouped paired-end SAM files. It can also optionally output discordant read pairs and/or split read mappings to separate SAM files, and/or unmapped/clipped reads to a separate FASTQ file. When marking duplicates, samblaster will require approximately 20MB of memory per 1M read pairs.
Autres paquets associés à samblaster
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
-
- dep: libstdc++6 (>= 5)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
Télécharger samblaster
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|
i386 | 25,1 ko | 61,0 ko | [liste des fichiers] |