Paquet : r-bioc-cner (1.34.0+dfsg-1)

[ Paquet source : r-bioc-cner  ]

CNE Detection and Visualization

Large-scale identification and advanced visualization of sets of conserved noncoding elements.

Autres paquets associés à r-bioc-cner

• dep: libc6 (>= 2.33)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-annotate (>= 1.50.0)

  annotations de BioConductor pour les puces à ADN

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.33.4)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.3)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.1.9)

  BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.23.16)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-go.db (>= 3.3.0)

  annotation maps describing the entire Gene Ontology

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.5.27)

  conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

• dep: r-bioc-keggrest (>= 1.14.0)

  GNU R client-side REST access to KEGG

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.25.5)

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.5.4)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-cran-dbi (>= 0.7)

  paquet de GNU R fournissant une interface généraliste de base de données

• dep: r-cran-ggplot2 (>= 2.1.0)

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-powerlaw (>= 0.60.3)

  GNU R analysis of heavy tailed distributions

• dep: r-cran-r.utils (>= 2.3.0)

  GNU R various programming utilities

• dep: r-cran-readr (>= 0.2.2)

  GNU R package to read rectangular text data

• dep: r-cran-reshape2 (>= 1.4.1)

  Flexibly reshape data: a reboot of the reshape package

• dep: r-cran-rsqlite (>= 0.11.4)

  Database Interface R driver for SQLite

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-gviz (>= 1.7.4)

  Plotting data and annotation information along genomic coordinates

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
i386	8 167,4 ko	17 943,0 ko	[liste des fichiers]