toutes les options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Paquet source : gsort  ]

Paquet : gsort (0.1.4-3 et autres)

Liens pour gsort

Screenshot

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source gsort :

Responsables :

Ressources externes :

Paquets similaires :

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Autres paquets associés à gsort

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances

Télécharger gsort

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Version Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
i386 0.1.4-3+b12 1 681,4 ko5 078,0 ko [liste des fichiers]