[ Paquet source : canu ]
Paquet : canu (2.0+dfsg-2 et autres)
Liens pour canu
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source canu :
Responsable :
Ressources externes :
- Page d'accueil [canu.readthedocs.org]
Paquets similaires :
assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
Canu est un fork de Celera Assembler, conçu pour le séquençage fortement bruité de molécules simples (comme PacBio RS II ou Oxford Nanopore MinION).
Canu est un processus d'assemblage hiérarchique fonctionnant en quatre étapes :
– détection des chevauchements dans les séquences très bruitées grâce à MHAP ; – génération du consensus de séquence corrigé ; – élagage des séquences corrigées ; – assemblage des séquences corrigées élaguées.
Autres paquets associés à canu
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- dep: gnuplot
- programme de tracé interactif en ligne de commande
un paquet virtuel est également fourni par gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libfilesys-df-perl
- Module to obtain filesystem disk space information
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- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: mhap
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
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- dep: perl
- langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall
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- sug: nanopolish
- identification de consensus pour les données de séquençage par nanopore
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- sug: pbgenomicconsensus
- Paquet indisponible
Télécharger canu
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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i386 | 2.0+dfsg-2+b1 | 1 317,8 ko | 10 030,0 ko | [liste des fichiers] |