Paquet : busco (5.4.4-1)

[ Paquet source : busco  ]

benchmarking sets of universal single-copy orthologs

Assessing genome assembly and annotation completeness with Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO).

 * Automated selection of lineages issued from https://www.orthodb.org/
 * Automated download of all necessary files and datasets to conduct a run
 * Use prodigal for non-eukaryotic genomes

Autres paquets associés à busco

• dep: bbmap

  BBTools genomic aligner and other tools for short sequences

• dep: hmmer

  profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences

• dep: prodigal

  Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-biopython

  bibliothèque de Python 3 pour la bio-informatique

• dep: python3-pandas

  structures de données pour des données « relationnelles » ou « étiquetées »

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	70,1 ko	410,0 ko	[liste des fichiers]
i386	70,1 ko	410,0 ko	[liste des fichiers]