Paquet : ncbi-entrez-direct (19.0.20230216+dfsg-2 et autres)

[ Paquet source : ncbi-entrez-direct  ]

NCBI Entrez utilities on the command line

Entrez Direct (EDirect) is an advanced method for accessing NCBI's set of interconnected databases (publication, sequence, structure, gene, variation, expression, etc.) from a terminal window or script. Functions take search terms from command-line arguments. Individual operations are combined to build multi-step queries. Record retrieval and formatting normally complete the process.

EDirect also provides an argument-driven function that simplifies the extraction of data from document summaries or other results that are returned in structured XML format. This can eliminate the need for writing custom software to answer ad hoc questions. Queries can move seamlessly between EDirect commands and UNIX utilities or scripts to perform actions that cannot be accomplished entirely within Entrez.

Autres paquets associés à ncbi-entrez-direct

• dep: curl

  outil en ligne de commande pour transférer des données avec une syntaxe URL

  ou wget

  récupération de fichiers sur le réseau

• dep: libc6 (>= 2.34)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• rec: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: curl

  outil en ligne de commande pour transférer des données avec une syntaxe URL

• sug: libxml-simple-perl

  Perl module for reading and writing XML

• sug: libxml2-utils

  GNOME XML library - utilities

• sug: perl

  langage de rapports et d'extractions pratiques de Larry Wall

Télécharger ncbi-entrez-direct

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
armel	19.0.20230216+dfsg-2+b1	4 838,6 ko	24 995,0 ko	[liste des fichiers]