Paquet : loki (2.4.7.4-10)

[ Paquet source : loki  ]

analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov

Ce programme opère une analyse de liaison multipoint par une méthode utilisant des chaînes de Markov Monte Carlo (MCMC) sur des généalogies complexes et de grande taille. Pour le moment, le paquet ne propose que l'analyse de caractères quantitatifs, mais cette restriction sera levée dans une version future. L'estimation combinée du nombre de QTL (Quantitative Trait Loci), de leur position et de leurs effets est faite par un saut réversible MCMC (RJMCMC). Il est aussi possible de faire des analyses de type « affected only IBD (Identity By Descent) sharing ».

Étiquettes: Domaine: Biologie, Mis en œuvre en: C, Interface utilisateur: interface::commandline, role::program, Champ d'application: Utilitaire, But: Étiquette supplémentaire nécessaire, use::analysing, works-with-format::TODO, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à loki

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• sug: loki-doc

  MCMC linkage analysis on general pedigrees (PS manual)

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
arm64	317,6 ko	824,0 ko	[liste des fichiers]