Paquet : r-bioc-singlecellexperiment (1.20.0+ds-1)

[ Paquet source : r-bioc-singlecellexperiment  ]

S4 Classes for Single Cell Data

Defines a S4 class for storing data from single-cell experiments. This includes specialized methods to store and retrieve spike-in information, dimensionality reduction coordinates and size factors for each cell, along with the usual metadata for genes and libraries.

Autres paquets associés à r-bioc-singlecellexperiment

• dep: r-api-4.0

  paquet virtuel fourni par r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-delayedarray

  BioConductor delayed operations on array-like objects

• dep: r-bioc-genomicranges

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-scrnaseq (>= 2.9.1)

  Collection of Public Single-Cell RNA-Seq Datasets

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-matrix

  paquet de GNU R de classes pour les matrices denses et creuses

• sug: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• sug: r-cran-rtsne

  t-SNE de GNU R utilisant l’algorithme de Barnes-Hut

• sug: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

Télécharger r-bioc-singlecellexperiment

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	807,0 ko	1 445,0 ko	[liste des fichiers]