Paquet : scoary (1.6.16-5)

[ Paquet source : scoary  ]

pangenome-wide association studies

Scoary is designed to take the gene_presence_absence.csv file from Roary as well as a traits file created by the user and calculate the associations between all genes in the accessory genome and the traits. It reports a list of genes sorted by strength of association per trait.

Autres paquets associés à scoary

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (>= 3.2)

• dep: python3-pkg-resources

  découverte de paquets et accès aux ressources avec pkg_resources

• dep: python3-scipy

  outils scientifiques pour Python 3

• sug: roary

  pipeline de pangénome autonome et très rapide

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	229,5 ko	2 686,0 ko	[liste des fichiers]