Tarkennettu haku
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]

Source Package: shasta (0.12.0-2)

Links for shasta

Debian-palvelut:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Seuraavat binääripaketit on käännetty tästä lähdepaketista:
python3-shasta
nanopore whole genome assembly (dynamic library)
python3-shasta-doc
nanopore whole genome assembly (documentation)
shasta
nanopore whole genome assembly (binaries and scripts)

Muut pakettiin shasta liittyvät paketit

  • build-depends
  • build-depends-indep
  • adep: debhelper-compat (= 13)
    Paketti ei saatavilla
  • adep: dh-python
    Debian helper tools for packaging Python libraries and applications
  • adep: dh-exec
    Scripts to help with executable debhelper files
  • adep: cmake
    Järjestelmäriippumaton, avoimen lähdekoodin make-järjestelmä
  • adep: patchelf
    modify properties of ELF executables
  • adep: chrpath
    Tool to edit the rpath in ELF binaries
  • adep: libboost-all-dev
    Boost C++ Libraries development files (ALL) (default version)
  • adep: libpng-dev
    PNG library - development (version 1.6)
  • adep: ncbi-blast+
    next generation suite of BLAST sequence search tools
  • adep: python3-dev
    header files and a static library for Python (default)
  • adep: python3-sphinx
    documentation generator for Python projects
  • adep: libpython3-dev
    header files and a static library for Python (default)
  • adep: libseqan2-dev (= 2.5.0~rc3+dfsg-1)
    C++ library for the analysis of biological sequences (development)
  • adep: libspoa-dev
    SIMD partial order alignment library (development files)
  • adep: python3-pybind11
    pybind11 helper module for Python 3
  • adep: libcpu-features-dev [any-amd64]
    cross platform C99 library to get cpu features
  • adep: libcereal-dev
    C++11 library for serialization
  • adep: libblas-dev
    Basic Linear Algebra Subroutines 3, static library
  • adep: liblapack-dev
    Library of linear algebra routines 3 - static version
  • adep: gfortran
    GNU Fortran 95 compiler

Download shasta

TiedostoKoko (kt)MD5-tarkiste
shasta_0.12.0-2.dsc 2.4 kt fb6ddd4025e82ca3c9380cffb019d0be
shasta_0.12.0.orig.tar.gz 9,377.1 kt 6f61f2536ecadcb827b822af5d22f8a6
shasta_0.12.0-2.debian.tar.xz 12.6 kt a3df47de6d9f90ae37bfe915446c9786
Debian Package Source Repository (VCS: Git)
https://salsa.debian.org/med-team/shasta.git
Debian Package Source Repository (Browsable)
https://salsa.debian.org/med-team/shasta