Source Package: sga (0.10.15-4)
Links for sga
Debian-palvelut:
Ylläpitäjät:
External Resources:
Seuraavat binääripaketit on käännetty tästä lähdepaketista:
- sga
- de novo genome assembler that uses string graphs
Muut pakettiin sga liittyvät paketit
-
- adep:
debhelper
(>= 11~)
- helper programs for debian/rules
-
- adep:
libsparsehash-dev
- Google's extremely memory-efficient C++ hash_map implementation
-
- adep:
zlib1g-dev
- compression library - development
- tai
libz-dev
- näennäispaketti, jonka toteuttaa
zlib1g-dev
-
- adep:
libbamtools-dev
- C++ API for manipulating BAM (genome alignment) files
-
- adep:
gawk
- GNU awk, etsintä- ja käsittelykieli
-
- adep:
help2man
- Automatic manpage generator
-
- adep:
samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- adep:
python
- interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
-
- adep:
python-ruffus
- Python computation pipeline library widely used in bioinformatics
-
- adep:
python-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 2)
