Paketti: ggd-utils (1.0.0+ds-1 ja muut) [debports]
Links for ggd-utils
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
programs for use in ggd
Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:
* a .tbi is present * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first line * the VCF has a #CHROM header * the chromosome are in the order specified by the genome file (and present) * the positions are sorted * the positions are <= the chromosome lengths defined in the genome file.
As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes
Muut pakettiin ggd-utils liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libgo22
- Runtime library for GNU Go applications
Imuroi ggd-utils
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
x32 (epävirallinen siirros) | 1.0.0+ds-1+b9 | 199.3 kt | 716.0 kt | [tiedostoluettelo] |