Paketti: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2 ja muut)

[ Source: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences (development)

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

This is the development library for libgkarrays.

Tagit: Software Development: Kirjastot, Role: Development Library

Muut pakettiin libgkarrays-dev liittyvät paketit

• dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2) [ei arm64]

  library to query large collection of NGS sequences

  dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2+b1) [arm64]

Imuroi libgkarrays-dev

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	92.8 kt	611.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	2.1.0+dfsg-4.2	83.2 kt	515.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	2.1.0+dfsg-4.2+b1	81.3 kt	513.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	2.1.0+dfsg-4.2	81.2 kt	461.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	2.1.0+dfsg-4.2	80.0 kt	439.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	96.0 kt	498.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2.1.0+dfsg-4.2	90.7 kt	495.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	100.7 kt	607.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	85.5 kt	478.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	2.1.0+dfsg-4.2	89.6 kt	563.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	86.3 kt	538.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2.1.0+dfsg-4.2	87.1 kt	531.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	2.1.0+dfsg-4.2	160.8 kt	1,390.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	2.1.0+dfsg-4.2	79.4 kt	510.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	85.0 kt	443.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	77.9 kt	514.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	2.1.0+dfsg-4.2	82.4 kt	468.0 kt	[tiedostoluettelo]