Paketti: spoa (4.1.4-1) [debports]

[ Source:  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

Muut pakettiin spoa liittyvät paketit

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libunwind8

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi spoa

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
ia64 (epävirallinen siirros)	41.3 kt	106.0 kt	[tiedostoluettelo]