Paketti: freebayes (1.3.6-2 ja muut) [debports]

[ Source:  ]

Bayesian haplotype-based polymorphism discovery and genotyping

FreeBayes is a Bayesian genetic variant detector designed to find small polymorphisms, specifically SNPs (single-nucleotide polymorphisms), indels (insertions and deletions), MNPs (multi-nucleotide polymorphisms), and complex events (composite insertion and substitution events) smaller than the length of a short-read sequencing alignment.

Muut pakettiin freebayes liittyvät paketit

• dep: libc6.1 (>= 2.37)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libseqlib2 (>= 1.2.0+dfsg)

  C++ htslib/bwa-mem/fermi interface for interrogating sequence data

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

  C++ wrapper to tabix indexer

• dep: libunwind8

  library to determine the call-chain of a program - runtime

• dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg)

  C++ library for parsing and manipulating VCF files

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• rec: parallel

  build and execute command lines from standard input in parallel

Imuroi freebayes

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
ia64 (epävirallinen siirros)	1.3.6-2+b1	1,561.5 kt	5,564.0 kt	[tiedostoluettelo]