Paketti: python3-cyvcf2 (0.31.1-2) [debports]
Links for python3-cyvcf2
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
VCF parser based on htslib (Python 3)
This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.
cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.
This package installs the library for Python 3.
Muut pakettiin python3-cyvcf2 liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6.1 (>= 2.7)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.13)
- dep: python3 (>= 3.12~)
-
- dep: python3-click
- Command-Line Interface Creation Kit - Python 3.x
-
- dep: python3-coloredlogs
- colored terminal output for Python 3's logging module
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: python3-numpy-abi9
- näennäispaketti, jonka toteuttaa python3-numpy
Imuroi python3-cyvcf2
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 846.6 kt | 5,669.0 kt | [tiedostoluettelo] |