Paketti: blasr (5.3.5+dfsg-6 ja muut) [debports]
Links for blasr
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti :
Ei löytynytYlläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [github.com]
Samankaltaisia paketteja:
mapping single-molecule sequencing reads
Basic local alignment with successive refinement (BLASR) is a method for mapping single-molecule sequencing reads against a reference genome. Such reads are thousands of bases long, with divergence between them and the genome being dominated by insertion and deletion error.
Muut pakettiin blasr liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg)
- tools for aligning PacBio reads to target sequences
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5)
- HDF5 - C++ runtime files - serial version
-
- dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg)
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
-
- dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg)
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
-
- dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~)
- library for analyzing PacBio sequencing data
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
Imuroi blasr
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
alpha (epävirallinen siirros) | 5.3.5+dfsg-6+b4 | 211.9 kt | 744.0 kt | [tiedostoluettelo] |