Paketti: r-bioc-pwalign (1.2.0-1)

[ Source: r-bioc-pwalign  ]

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

Perform pairwise sequence alignments

The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.

Muut pakettiin r-bioc-pwalign liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  Paketti ei saatavilla

• dep: r-api-bioc-3.20

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-iranges

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Imuroi r-bioc-pwalign

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
riscv64	736.5 kt	1,089.0 kt	[tiedostoluettelo]