Tarkennettu haku
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Source: fermi-lite  ]

Paketti: fml-asm (0.1+git20190320.b499514-2~0exp)

Links for fml-asm

Screenshot

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti fermi-lite:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Samankaltaisia paketteja:

Kokeellinen paketti

Varoitus: Tämä paketti on kokeellisesta jakelusta. Tämä tarkoittaa, että se on luultavasti epävakaa tai buginen, ja voi aiheuttaa jopa tiedonhäviötä. Kannattaa ehdottomasti tutustua muutoslokiin ja muihin mahdollisiin ohjeisiin ennen käyttöönottoa.

tool for assembling Illumina short reads in small regions

Fml-asm is a command-line tool for assembling Illumina short reads in regions from 100bp to 10 million bp in size, based on the fermi-lite library. It is largely a light-weight in-memory version of fermikit without generating any intermediate files. It inherits the performance, the relatively small memory footprint and the features of fermikit. In particular, fermi-lite is able to retain heterozygous events and thus can be used to assemble diploid regions for the purpose of variant calling.

Muut pakettiin fml-asm liittyvät paketit

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
    myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi fml-asm

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri Paketin koko Koko asennettuna Tiedostot
i386 84.5 kt198.0 kt [tiedostoluettelo]