Paketti: cassiopee (1.0.9-2)

[ Source: cassiopee  ]

index and search tool in genomic sequences

Cassiopee index and search library C implementation. It is a complete rewrite of the ruby Cassiopee gem. It scans an input genomic sequence (dna/rna/protein) and search for a subsequence with exact match or allowing substitutions (Hamming distance) and/or insertion/deletions.

This package contains the cassiopee and cassiopeeknife tools.

Muut pakettiin cassiopee liittyvät paketit

• dep: libboost-iostreams1.67.0

  Boost.Iostreams -kirjasto

• dep: libboost-regex1.67.0 (>= 1.67.0-10)

  regular expression library for C++

• dep: libboost-serialization1.67.0

  serialization library for C++

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]

• dep: libcassie1v5

  library implementating search algorithms

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [ei armhf]

  GCC:n apukirjasto

  dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]

• dep: libgomp1 (>= 4.2.1)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libgoogle-glog0v5

  library that implements application-level logging.

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

Imuroi cassiopee

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	17.5 kt	75.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	17.0 kt	67.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	15.7 kt	53.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	17.8 kt	65.0 kt	[tiedostoluettelo]