Paketti: bowtie (1.2.2+dfsg-4)
Links for bowtie
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti bowtie:
Ylläpitäjät:
- Debian Med Packaging Team (Laadunvalvontasivu, Mail Archive)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
- Ognyan Kulev (Laadunvalvontasivu)
- Stephan Struckmann (Laadunvalvontasivu)
- Alexandre Mestiashvili (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [bowtie-bio.sourceforge.net]
Samankaltaisia paketteja:
Ultrafast memory-efficient short read aligner
This package addresses the problem to interpret the results from the latest (2010) DNA sequencing technologies. Those will yield fairly short stretches and those cannot be interpreted directly. It is the challenge for tools like Bowtie to give a chromosomal location to the short stretches of DNA sequenced per run.
Bowtie aligns short DNA sequences (reads) to the human genome at a rate of over 25 million 35-bp reads per hour. Bowtie indexes the genome with a Burrows-Wheeler index to keep its memory footprint small: typically about 2.2 GB for the human genome (2.9 GB for paired-end).
Muut pakettiin bowtie liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.27)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: libtbb2
- parallelism library for C++ - runtime files
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- sug: bowtie-examples
- Examples for bowtie, the ultrafast memory-efficient short read aligner
Imuroi bowtie
Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|
arm64 | 1,244.6 kt | 6,387.0 kt | [tiedostoluettelo] |