Paketti: seqtk (1.3-2)

[ Source: seqtk  ]

Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format

Currently, seqtk supports quality based trimming with the phred algorithm, converting fastq to fasta, reverse complementing sequences, extracting or masking subsequences in regions given in a BED/name list file, and more. It contains a subsampling module to sample exactly n sequences or a fraction of sequences.

Seqtk supports both fasta and fastq input files, which can be optionally gzip compressed.

Muut pakettiin seqtk liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi seqtk

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	29.0 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	27.3 kt	75.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	27.6 kt	79.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	27.3 kt	63.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	32.1 kt	91.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	28.2 kt	89.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	28.6 kt	84.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	32.8 kt	151.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	27.1 kt	83.0 kt	[tiedostoluettelo]