Paketti: r-bioc-titancna (1.28.0-2)

[ Source: r-bioc-titancna  ]

Subclonal copy number and LOH prediction from whole genome sequencing

Hidden Markov model to segment and predict regions of subclonal copy number alterations (CNA) and loss of heterozygosity (LOH), and estimate cellular prevalence of clonal clusters in tumour whole genome sequencing data.

Muut pakettiin r-bioc-titancna liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.1.3) [i386]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.2) [mips64el, mipsel, s390x]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf]

• dep: r-api-4.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.12

  näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.0.3-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.31.6)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.8.7)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.24.3)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.6.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-variantannotation (>= 1.18.7)

  BioConductor annotation of genetic variants

• dep: r-cran-data.table (>= 1.10.4)

  GNU R extension of Data.frame

• dep: r-cran-dplyr (>= 0.5.0)

  GNU R grammar of data manipulation

• dep: r-cran-foreach (>= 1.4.3)

  GNU R foreach looping support

Imuroi r-bioc-titancna

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	3,858.4 kt	7,619.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	3,857.4 kt	7,615.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	3,858.9 kt	7,614.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	3,857.2 kt	7,610.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	3,858.2 kt	7,614.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	3,857.0 kt	7,616.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	3,857.1 kt	7,615.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	3,858.7 kt	7,663.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	3,857.0 kt	7,615.0 kt	[tiedostoluettelo]