Paketti: libbio-db-hts-perl (3.01-3 ja muut)

[ Source: libbio-db-hts-perl  ]

Perl interface to the HTS library

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension 'csi' (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

This package provides a Perl interface to the HTS library.

Muut pakettiin libbio-db-hts-perl liittyvät paketit

• dep: libbio-perl-perl

  BioPerl core perl modules

• dep: libc6 (>= 2.4)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libhts3 (>= 1.10)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: perl (>= 5.32.0-4)

  Larry Wallin kieli tekstitiedostojen analysointia ja raportointia varten

• dep: perlapi-5.32.0

  näennäispaketti, jonka toteuttaa perl-base

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libbio-db-hts-perl

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
mipsel	3.01-3+b1	142.2 kt	482.0 kt	[tiedostoluettelo]