Paketti: r-cran-bio3d (2.4-1-1 ja muut)
Links for r-cran-bio3d
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti r-cran-bio3d:
Ylläpitäjät:
- Debian R Packages Maintainers (Laadunvalvontasivu)
- Steffen Moeller (Laadunvalvontasivu)
- Andreas Tille (Laadunvalvontasivu)
External Resources:
- Kotisivu [cran.r-project.org]
Samankaltaisia paketteja:
GNU R -paketti biologiseen rakenneanalyysiin
bio3d-paketti sisältää työkaluja proteiinirakenteiden, sekvenssien ja dynamiikkadatan käsittelyyn, järjestelyyn ja tutkimiseen. Ominaisuuksia ovat rakenteiden, sekvenssidatan ja dynaamisen kehittymisdatan lukeminen ja kirjoittaminen, atomiyhteenvetojen suorittaminen, atomin valinta, uudelleensuuntaus, kerrostaminen (superpositio), klusterointi, vääntöanalyysi, etäisyysmatriisianalyysi, rakenteen ja sekvenssin säilymisanalyysi sekä pääkomponenttianalyysi (PCA). Lisäksi monilla apufunktioilla on mahdollista käyttää R-ympäristön tilastollisia ja graafisia ominaisuuksia biologisten sekvenssien ja rakennedatojen kanssa työskentelyyn.
Muut pakettiin r-cran-bio3d liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.4)
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC:n apukirjasto
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
-
- dep: r-api-4.0
- näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core
-
- dep: r-base-core (>= 4.0.0-3)
- GNU R core of statistical computation and graphics system
-
- dep: r-cran-rcpp
- GNU R package for Seamless R and C++ Integration
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot
-
- rec: clustalo
- General-purpose multiple sequence alignment program for proteins
-
- rec: dssp
- protein secondary structure assignment based on 3D structure
-
- rec: muscle
- Multiple alignment program of protein sequences
-
- rec: mustang
- multiple structural alignment of proteins
-
- rec: r-cran-testthat (>= 0.9.1)
- GNU R testsuite
-
- sug: r-bioc-biostrings
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- sug: r-cran-bigmemory
- Manage Massive Matrices with Shared Memory and Memory-Mapped Files
-
- sug: r-cran-httr
- GNU R tools for working with URLs and HTTP
-
- sug: r-cran-igraph
- GNU R network analysis and visualization
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
-
- sug: r-cran-lattice
- GNU R package for 'Trellis' graphics
-
- sug: r-cran-ncdf4
- GNU R interface to Unidata netCDF format data files
-
- sug: r-cran-rcurl
- GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
-
- sug: r-cran-xml
- GNU R package for XML parsing and generation
Imuroi r-cran-bio3d
Arkkitehtuuri | Versio | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
---|---|---|---|---|
mips64el | 2.4-1-1+b1 | 2,831.4 kt | 3,933.0 kt | [tiedostoluettelo] |