Paketti: gsort (0.1.4-3 ja muut)

[ Source: gsort  ]

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Muut pakettiin gsort liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.3.6-6~) [i386]

  dep: libc6 (>= 2.4) [ei arm64, i386, ppc64el]

Imuroi gsort

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	0.1.4-3+b6	1,705.1 kt	5,379.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	0.1.4-3+b6	1,454.0 kt	4,966.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	0.1.4-3+b6	1,485.7 kt	4,613.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	0.1.4-3+b6	1,480.4 kt	4,613.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	0.1.4-3+b6	1,620.6 kt	4,579.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	0.1.4-3+b6	1,375.7 kt	5,457.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	0.1.4-3+b6	1,400.7 kt	5,105.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	0.1.4-3+b6	1,429.0 kt	5,030.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	0.1.4-3+b6	1,559.0 kt	5,289.0 kt	[tiedostoluettelo]