Paketti: minia (3.2.1+git20200522.4960a99-1)

[ Source: minia  ]

short-read biological sequence assembler

Short-read DNA sequence assembler based on a de Bruijn graph, capable of assembling a human genome on a desktop computer in a day.

The output of Minia is a set of contigs. Minia produces results of similar contiguity and accuracy to other de Bruijn assemblers (e.g. Velvet).

Muut pakettiin minia liittyvät paketit

• dep: bc

  GNU bc, rajattoman tarkka laskentakieli

• dep: libc6 (>= 2.14)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgatbcore3 (>= 1.4.1+git20191130.664696c+dfsg)

  dynamic library of the Genome Analysis Toolbox

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libhdf5-103-1

  HDF5 C runtime files - serial version

• dep: libstdc++6 (>= 9)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: zlib1g

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

• rec: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: bandage

  Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily

Imuroi minia

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	388.9 kt	740.0 kt	[tiedostoluettelo]