Paketti: libhts3 (1.16+ds-3)

[ Source: htslib  ]

C library for high-throughput sequencing data formats

HTSlib is an implementation of a unified C library for accessing common file formats, such as SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM and VCF (Variant Call Format), used for high-throughput sequencing data, and is the core library used by samtools and bcftools. HTSlib only depends on zlib. It is known to be compatible with gcc, g++ and clang.

HTSlib implements a generalized BAM (binary SAM) index, with file extension ‘csi’ (coordinate-sorted index). The HTSlib file reader first looks for the new index and then for the old if the new index is absent.

Tagit: Role: Shared Library

Muut pakettiin libhts3 liittyvät paketit

• dep: libbz2-1.0

  high-quality block-sorting file compressor library - runtime

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)

  easy-to-use client-side URL transfer library (GnuTLS flavour)

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libhtscodecs2 (>= 1.3.0)

  Custom compression for CRAM and others

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  XZ-tiedostomuodon pakkauskirjasto

• dep: libssl3 (>= 3.0.0)

  Secure Sockets Layer -työkalupakki - jaetut kirjastot

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libhts3

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
mips64el	377.8 kt	1,301.0 kt	[tiedostoluettelo]