Paketti: megahit (1.2.9-4)

[ Source: megahit  ]

ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler

Megahit is an ultra-fast and memory-efficient NGS assembler. It is optimized for metagenomes, but also works well on generic single genome assembly (small or mammalian size) and single-cell assembly.

The software was praised in a Briefings in Bioinformatics 5/2020 review (DOI: 10.1093/bib/bbaa085).

Muut pakettiin megahit liittyvät paketit

• dep: bzip2

  high-quality block-sorting file compressor - utilities

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

  GCC:n apukirjasto

• dep: libgomp1 (>= 6)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: libstdc++6 (>= 12.2.0-9)

  GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-all

  package depending on all supported Python 3 runtime versions

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi megahit

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1,117.2 kt	8,063.0 kt	[tiedostoluettelo]