Paketti: genomethreader (1.7.3+dfsg-7)

[ Source: genomethreader  ]

software tool to compute gene structure predictions

GenomeThreader is a software tool to compute gene structure predictions. The gene structure predictions are calculated using a similarity-based approach where additional cDNA/EST and/or protein sequences are used to predict gene structures via spliced alignments. GenomeThreader was motivated by disabling limitations in GeneSeqer, a popular gene prediction program which is widely used for plant genome annotation.

Muut pakettiin genomethreader liittyvät paketit

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
  myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

• dep: libexpat1 (>= 2.0.1)

  XML parsing C library - runtime library

• dep: libgenometools0 (>= 1.6.2+ds)

  versatile genome analysis library

• dep: liblua5.1-0

  Shared library for the Lua interpreter version 5.1

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi genomethreader

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille

Arkkitehtuuri	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	2,008.6 kt	22,293.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1,909.9 kt	22,483.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1,865.1 kt	22,279.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1,880.6 kt	21,127.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	2,034.7 kt	22,927.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1,925.3 kt	23,539.0 kt	[tiedostoluettelo]
mipsel	1,931.6 kt	23,307.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	2,038.0 kt	24,021.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1,904.7 kt	22,435.0 kt	[tiedostoluettelo]