Paket: ray (2.3.1-9)

[ Quellcode: ray  ]

De-novo-Genomassemblierung von »Next Generation Sequencing«-Daten

Ray ist eine Parallelsoftware zur Berechnung von De-novo-Genomassemblierungen mithilfe von durch Next Generation Sequencing gewonnenen Daten. Die Software ist in C++ geschrieben und kann parallel auf mehreren miteinander verbundenen Computern laufen. Sie nutzt den MPI-Standard (message-passing interface).

Ray beinhaltet:

 - Ray        De-novo-Assemblierung einzelner Genome
 - Ray Méta   De-novo-Assemblierung von Metagenomen
 - Ray Communities  Mikrobenfülle + taxonomisches Profiling
 - Ray Ontologies   Gen-Ontologie-Profiling

Andere Pakete mit Bezug zu ray

• dep: libbz2-1.0

  Hochwertiger, Blöcke sortierender Dateikomprimierer - Laufzeitbibliothek

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, ppc64el, s390x]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, mips64el, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libmpich12 (>= 4.2.1) [armel, armhf, i386]

  Shared libraries for MPICH

• dep: libopenmpi40 (>= 5.0.6) [nicht armel, armhf, i386]

  Leistungsstarke Message-Passing-Bibliothek - Laufzeitbibliotheken

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: mpi-default-bin

  Standard-MPI-Laufzeitdateien (Metapaket)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nicht armel, armhf]

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf]

ray herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	863,9 kB	2.449,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	789,2 kB	2.353,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	746,9 kB	2.136,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	768,8 kB	1.672,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	927,6 kB	2.660,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	813,3 kB	3.023,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	853,1 kB	2.801,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	851,9 kB	1.941,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	848,5 kB	2.481,0 kB	[Liste der Dateien]