Paket: python3-htseq (2.0.9+dfsg-1 und andere)

[ Quellcode: htseq  ]

Python3 high-throughput genome sequencing read analysis utilities

HTSeq can be used to performing a number of common analysis tasks when working with high-throughput genome sequencing reads:

  * Getting statistical summaries about the base-call quality scores to
    study the data quality.
  * Calculating a coverage vector and exporting it for visualization in
    a genome browser.
  * Reading in annotation data from a GFF file.
  * Assigning aligned reads from an RNA-Seq experiments to exons and
    genes.

Andere Pakete mit Bezug zu python3-htseq

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, mips64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nicht armel, armhf]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

  dep: python3 (<< 3.14)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-numpy

  Python library for numerical computations (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy

  oder python3-numpy-abi9

  Paket nicht verfügbar

• dep: python3-pysam

  interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)

python3-htseq herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.0.9+dfsg-1+b2	313,1 kB	1.095,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	2.0.9+dfsg-1+b2	279,2 kB	1.111,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	2.0.9+dfsg-1+b2	279,8 kB	1.035,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	2.0.9+dfsg-1+b2	285,0 kB	907,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.0.9+dfsg-1+b2	312,6 kB	1.140,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	2.0.9+dfsg-1+b2	256,2 kB	1.199,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	2.0.9+dfsg-1+b2	300,3 kB	1.303,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	2.0.9+dfsg-1+b2	308,3 kB	903,0 kB	[Liste der Dateien]