Paket: r-bioc-biostrings (2.72.1+dfsg-1)

[ Quellcode: r-bioc-biostrings  ]

GNU R string objects representing biological sequences

Memory efficient string containers, string matching algorithms, and other utilities, for fast manipulation of large biological sequences or set of sequences.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-biostrings

• dep: libc6 (>= 2.17)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: r-api-4.0

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.19

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.50.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.40.1)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.38.1)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.42.1)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.44.0)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-cran-crayon

  GNU R colored terminal output

• sug: r-bioc-affy (>= 1.82.0)

  BioConductor methods for Affymetrix Oligonucleotide Arrays

• sug: r-bioc-biocstyle (>= 2.32.1)

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.72.0)

  BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages

• sug: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.56.0)

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• sug: r-bioc-pwalign (>= 1.0.0-2~0exp1)

  Perform pairwise sequence alignments

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

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