Paket: bwa (0.7.17-7 und andere)
Links für bwa
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket bwa herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
- Carlos Borroto (QS-Seite)
- Ognyan Kulev (QS-Seite)
- Michael R. Crusoe (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [bio-bwa.sourceforge.net]
Ähnliche Pakete:
Burrows-Wheeler Aligner
BWA (Burrows-Wheeler Aligner) ist ein Softwarepaket für das Abbilden gering abweichender Sequenzen auf eine große Referenzsequenz, etwa das menschliche Genom. Es besteht aus drei Algorithmen: BWA-backtrack, BWA-SW und BWA-MEM. BWA-backtrack ist für Illumina-Sequenz-Reads bis zu 100 Basenpaaren (bp) geeignet, während die anderen zwei Algorithmen für längere Sequenzen zwischen 70 bp und 1 Megabasenpaaren (Mbp) geeignet sind. BWA-MEM und BWA-SW teilen ähnliche Merkmale wie Unterstützung für lange Reads und Split-Alignments. BWA-MEM ist jedoch neuer und wird für hochqualitative Anfragen empfohlen, da es schneller und genauer ist. BWA-MEM ist zudem für Illumina-Reads mit einer Länge von 70 bis 100 bp leistungsfähiger als BWA-backtrack.
Andere Pakete mit Bezug zu bwa
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- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Kompressions-Bibliothek - Laufzeit
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- rec: perl
- Larry Wall's Practical Extraction und Report Language
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- sug: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
bwa herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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ppc64el | 0.7.17-7+b4 | 224,5 kB | 576,0 kB | [Liste der Dateien] |