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Paket: plink (1.07+dfsg-4 und andere)

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Werkzeugsatz für die Analyse von Zusammenhängen im gesamten Genom

Plink erwartet als Eingabe die Daten aus SNP-Chips (Single Nucleotide Polymorphismus) von vielen einzelnen Individuen und deren phänotypische Beschreibung einer Krankheit. Das Programm findet Verbindungen von einzelnen oder Paaren von DNA-Varianten mit einem Phänotyp. Es kann SNP-Erläuterungen aus einer Online-Quelle abrufen.

SNPs können einzeln oder als Paar auf ihren Zusammenhang mit Krankheitsphänotypen bewertet werden. Die gemeinsame Untersuchung von Varianten von Genkopien wird unterstützt. Eine Vielzahl von statistischen Tests wurde implementiert.

Bitte beachten Sie: Die ausführbare Anwendung wurde wegen eines Namenskonflikts zu plink1 umbenannt. Mehr dazu unter /usr/share/doc/plink/README.Debian.

Markierungen: Feld: Biologie, Bioinformatik, Implementiert in: implemented-in::c++, interface::commandline, Rolle: Programm, Zweck: Analyse

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