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Paket: rasmol (2.7.6.0-3 und andere)

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Visualisierung biologischer Makromoleküle

RasMol ist ein Grafikprogramm zur Moleküldarstellung, das die dreidimensionale Anordnung von Proteinen, Nukleinsäuren und beliebigen kleinen Molekülen visualisiert. Hierbei wird auf die Verwendbarkeit in der Forschung und Lehre Wert gelegt und auch auf eine druckreife Qualität der Darstellungen.

Das Programm liest eine Datei mit Koordinaten ein und zeigt das Molekül interaktiv am Bildschirm an, mit der Möglichkeit zur Veränderung von Farben und der Gestalt der Atome. Derzeit verfügbare Abbildungen sind »depth-cued«-Drahtmodelle, »Dreiding«-Sticks, raumfüllende (CPK-)Kugeln, Stäbchenmodell, sekundäre Strukturen wie Faltblätter und Helices, Atombeschriftungen und Punktoberflächen.

Unterstützt werden Dateien aus der Protein Data Bank (PDB), Tripos Associates' Alchemy und Sybyl-Mol2-Formate, Molecular Design Limiteds (MDL) Mol-Dateiformat, Minnesota Supercomputer Centers (MSC) XYZ- (XMol-)Format, CHARMm-Format, CIF-Format und mmCIF formatierte Dateien.

Dieses Paket installiert zwei Versionen von RasMol, rasmol-gtk hat eine moderne GTK-basierte Bedienoberfläche und rasmol-classic die Xlib-GUI.

Markierungen: Feld: Chemie, Benutzer-Schnittstellen: Graphical User Interface, X-Window-System, Rolle: role::program, scope::utility, GUI-Baukasten: GTK, Zweck: Lernen, use::viewing, x11::application

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mips64el 2.7.6.0-3+b1 664,8 kB4.682,0 kB [Liste der Dateien]