Paket: metabat (2.15-4 und andere)

[ Quellcode: metabat  ]

robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data

MetaBAT integrates empirical probabilistic distances of genome abundance and tetranucleotide frequency for accurate metagenome binning. MetaBAT outperforms alternative methods in accuracy and computational efficiency on both synthetic and real metagenome datasets. It automatically forms hundreds of high quality genome bins on a very large assembly consisting millions of contigs in a matter of hours on a single node.

Andere Pakete mit Bezug zu metabat

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  GCC Support-Bibliothek

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

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Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
amd64	2.15-4+b1	509,2 kB	1.880,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	2.15-4+b1	538,4 kB	1.923,0 kB	[Liste der Dateien]