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Paket: theseus (3.3.0-14 und andere)

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Maximum-Likelihood-Überlagerung von Makromolekülen

Das Programm Theseus überlagert gleichzeitig mehrere makromolekulare Strukturen. Theseus findet die optimale Lösung für das Überlagerungsproblems mit der Maximum-Likelihood-Methode. Mit dem »down-weighting« variabler Regionen der Überlagerung und durch einen Ausgleich für Korrelationen zwischen Atomen produziert die ML-Überlagerungsmethode sehr genaue strukturelle Alignments (Ausrichtungen).

Wenn Makromoleküle mit verschiedenen Restsequenzen überlagert werden, verwerfen andere Programme und Algorithmen die mit Lücken ausgerichteten Restsequenzen. Theseus verwendet jedoch einen neuartigen Überlagerungsalgorithmus, der alle Daten verarbeitet.

Markierungen: Biologie: Proteine, Feld: Biologie, field::biology:bioinformatics, field::biology:structural, Implementiert in: C, Benutzer-Schnittstellen: interface::commandline, role::program, Zweck: Analyse, use::comparing, works-with-format::plaintext

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