Paket: garlic-doc (1.6-1.1)

[ Quellcode: garlic-doc  ]

[Chemie] Ein Molekül-Darstellungsprogramm - Doku

Dies ist das Dokumentationspaket für Garlic.

Garlic ist wahrscheinlich das portabelste Moleküldarstellungs- programm in der Unix-Welt. Es wurde geschrieben, um Membran- Proteine zu untersuchen. Es kann benutzt werden, um andere Proteine darzustellen, sowie auch einige geometrische Objekte. Der Name hat etwas mit der Struktur und Bedienung dieses Programmes zu tun. Diese Version von Garlic erkennt das PDB-Format in der Version 2.1. Garlic kann auch zur Analyse von Proteinsequenzen verwendet werden.

Garlic hat folgende Eigenschaften (und mehr):

 o Die Slab-Position und Dicke sind in einem kleinen Fenster sichtbar
 o Atomare Bindungen werden ebenso wie Atome als unabhängig
   darstellbare Objekte behandelt
 o Die Atom- und Bindungsfarben hängen von ihrer Position ab. Fünf
   Abbildungsmodi sind verfügbar (wie für die Slabs).
 o Die Möglichkeit, Stereobilder darzustellen
 o Die Möglichkeit, andere geometrische Objekte darzustellen,
   z.B. eine Membrane.
 o Informationenn über Atome unter dem Mauszeiger sind verfügbar.
   Kein Click wird benötigt, einfach den Mauszeiger über die
   Struktur bewegen.
 o Die Möglichkeit, mehr als eine Struktur zu laden.
 o Die Möglichkeit, Ramachandran-Plots, spiralenförmige Räder,
   Venn-Diagramme, gemittelte hydrophobizität und Hydrophobizitäts
   Moments-Plots
 o Die Kommandozeilenaufforderung ist am unteren Ende des Haupt-
   fensters verfügbar. Sie kann eine Fehlermeldung und einen
   Befehl darstellen.

Markierungen: Feld: Biologie, Chemie, Rolle: Dokumentation, role::program, use::viewing

Andere Pakete mit Bezug zu garlic-doc

• rec: garlic

  visualization program for biomolecules

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