Paket: exonerate (2.4.0-5 und andere)
Links für exonerate
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket exonerate herunterladen:
Betreuer:
- Debian Med Packaging Team (QS-Seite, E-Mail-Archiv)
- Steffen Moeller (QS-Seite)
- Charles Plessy (QS-Seite)
- Andreas Tille (QS-Seite)
Externe Ressourcen:
- Homepage [www.ebi.ac.uk]
Ähnliche Pakete:
Generisches Werkzeug zum paarweisen Sequenzvergleich
Mit Exonerate können Sie Sequenzen ab- und vergleichen. Das Programm bietet Ihnen viele Alignment-Modelle, welche entweder vollständig dynamische Programmierung oder eine Reihe von heuristischen Methoden verwenden. Ein Großteil der Funktionalität der »Wise dynamic programming suite« wurde zur Erhöhung der Effizienz in C neu geschrieben. Exonerate ist eine wesentliche Komponente bei der Erstellung der »Ensembl Genome«-Datenbanken, die Ähnlichkeitsmaße für RNA- und DNA-Sequenzen bestimmt und so allgemein »splice variants« und Codesequenzen bestimmt.
Ein »In-silico PCR«-System zur Simulation von Experimenten (Siehe auch das Handbuch von »ipcress«) wird zusammen mit »exonerate« verteilt.
Dieses Paket beinhaltet auch eine Auswahl an Werkzeugen zur Erstellung einfacher, schneller Änderungen an »fasta«-Dateien mit über 2GB Dateigröße.
Andere Pakete mit Bezug zu exonerate
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
-
- dep: libglib2.0-0t64 (>= 2.75.3)
- GLib - Bibliothek von C-Routinen
-
- sug: wise
- Vergleich biologischer Polymere, wie DNA- und Protein-Sequenzen
-
- enh: bioperl-run
- BioPerl-Hüllen: Skripte
exonerate herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
---|---|---|---|---|
amd64 | 2.4.0-5+b1 | 1.917,3 kB | 9.639,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 2.4.0-5+b1 | 1.724,5 kB | 10.163,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 2.4.0-5+b1 | 1.541,5 kB | 9.362,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 2.4.0-5+b1 | 1.622,2 kB | 6.434,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 2.4.0-5+b1 | 2.028,0 kB | 10.410,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 2.4.0-5+b1 | 1.728,5 kB | 11.371,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 2.4.0-5+b1 | 1.793,6 kB | 12.595,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 2.4.0-5+b2 | 1.963,4 kB | 8.123,0 kB | [Liste der Dateien] |
s390x | 2.4.0-5+b1 | 2.233,5 kB | 11.559,0 kB | [Liste der Dateien] |