Paket: ataqv (1.3.1+ds-2 und andere)

[ Quellcode: ataqv  ]

ATAC-seq QC and visualization

A toolkit for measuring and comparing ATAC-seq results, made in the Parker lab at the University of Michigan. They wrote it to help understand how well their ATAC-seq assays had worked, and to make it easier to spot differences that might be caused by library prep or sequencing.

Markierungen: GUI-Baukasten: Ncurses TUI

Andere Pakete mit Bezug zu ataqv

• dep: fonts-font-awesome

  Symbol-Schriftart für die Verwendung mit Twitter Bootstrap

• dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

  C++-Darstellung von Zeitspannen, Zeitpunkten und Uhren

• dep: libboost-filesystem1.83.0 (>= 1.83.0)

  Dateisystemoperationen (portable Pfade, Iterationen über Verzeichnisse, usw.) in C++

• dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

  Boost.Iostreams-Bibliothek

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
  auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate

• dep: libjs-jquery

  JavaScript-Bibliothek für dynamische Webanwendungen

• dep: libjs-jquery-datatables

  jQuery-Plug-in, das aus verschiedenen Datenquellen schöne Tabellen erstellt

• dep: libjs-jquery-datatables-extensions

  extensions for the jQuery plug-in for tables from different data sources

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Laufzeitbibliotheken zur Terminalsteuerung

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

• dep: node-d3

  Data-Driven Documents to visualize data

• dep: node-normalize.css

  Moderne Alternative zum Rücksetzen von Cascading Style Sheets

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• sug: macs

  Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

• sug: picard-tools

  Command line tools to manipulate SAM and BAM files

• sug: samtools

  processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

• sug: wget

  Lädt Dateien aus dem Web

ataqv herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen

Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
armhf	1.3.1+ds-2+b2	3.246,5 kB	5.848,0 kB	[Liste der Dateien]