Paket: r-cran-sctransform (0.4.1-1)

[ Quellcode: r-cran-sctransform  ]

Variance Stabilizing Transformations for Single Cell UMI Data

A normalization method for single-cell UMI count data using a variance stabilizing transformation. The transformation is based on a negative binomial regression model with regularized parameters. As part of the same regression framework, this package also provides functions for batch correction, and data correction. See Hafemeister and Satija 2019 <doi:10.1101/576827> for more details.

Andere Pakete mit Bezug zu r-cran-sctransform

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  Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

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• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
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• dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

  GCC Support-Bibliothek

• dep: liblapack3

  Bibliothek von Routinen für Lineare Algebra (3) - gemeinsame Version

  oder liblapack.so.3

  virtuelles Paket, bereitgestellt durch liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

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• dep: r-cran-gridextra

  GNU R: Erweiterungen für das grid-Paket

• dep: r-cran-magrittr

  GNU R forward-pipe operator

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• dep: r-cran-rcpp (>= 0.11.0)

  GNU-R-Paket für die nahtlose Verflechtung von R und C++

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• dep: r-cran-rlang

  Functions for Base Types and Core R and 'Tidyverse' Features

• rec: r-cran-irlba

  GNU R fast truncated SVD, PCA and symmetric eigendecomposition

• rec: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• rec: r-cran-testthat

  GNU R testsuite

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